Odjel za humanu mikrobiologiju djeluje u okviru Službe za epidemiologiju zaraznih bolesti i zapošljava 2 doktora medicine, jedan je specijalist mikrobiologije i parazitologije, a drugi specijalizant kliničke mikrobiologije, 2 viša laboratorijska tehničara, 3 srednja laboratorijska tehničara i prateće osoblje.
Na Odjelu se rade sanitarni pregledi ljudi zaposlenih u zdravstvu te ljudi koji su prirodom svog posla vezani za proizvodnju i distribuciju hrane (restorani, trgovine, tvornice hrane).
Posljednje dvije godine u okviru našeg Odjela je i laboratorij za molekularnu dijagnostiku, u kojem vršimo molekularni sentinel nadzor nad respiratornim infekcijama, a u planu je i nadzor nad virusima, koje prenose komarci, kao što je virus Zapadnog Nila.