Zavod za javno zdravstvo Federacije Bosne i Hercegovine je zdravstvena ustanova koja obavlja javnozdravstvenu djelatnost na području Federacije Bosne i Hercegovine preko svojih sektora, službi i odjela.
Osnivač Zavoda je Parlament Federacije Bosne i Hercegovine u skladu s člankom 54. stavak (1) Zakona o zdravstvenoj zaštiti („Službene novine Federacije BiH”, br. 46/10 i 75/13).
Djelatnost Zavoda definirana je čl. 116. i 117. istog Zakona. Između ostalog, Zavod za javno zdravstvo Federacije Bosne i Hercegovine predlaže Federalnom ministarstvu zdravstva razvitak politika vezanih za javno zdravstvo i sudjeluje u njihovom provođenju.
Tijela upravljanja, rukovođenja i nadzora nad radom Zavoda za javno zdravstvo Federacije Bosne i Hercegovine su Upravno vijeće, Ravnatelj i Nadzorno vijeće. Stručna tijela Zavoda za javno zdravstvo Federacije Bosne i Hercegovine su Stručno vijeće i Etički komitet.
Zavod za javno zdravstvo Federacije BiH funkcionira u dvije organizacijske jedinice, u Sarajevu i Mostaru, koje čine jedinstvenu funkcionalnu cjelinu.
Misija Zavoda za javno zdravstvo Federacije Bosne i Hercegovine je biti vodeća stručna, istraživačka i nastavna ustanova iz oblasti javnog zdravstva, od punog povjerenja građana, struke i vlasti, koja kroz nadzor i istraživanje, edukaciju, promociju zdravlja i prevenciju bolesti, suradnju i koordinaciju s drugim ustanovama aktivno utječe na unaprjeđenje organizacije zdravstvene zaštite i zdravlja stanovništva Frederacije BiH.
Vizija Zavoda za javno zdravstvo Federacije Bosne i Hercegovine je očuvanje vodeće uloge u oblasti javnog zdravstva, u suradnji sa zdravstvenim ustanovama, drugim sektorima i uz podršku zajednice kreirati uvjete za ostvarenje koncepta „zdravi ljudi u zdravoj zajednici“.