• Nadzorno vijeće Zavoda za javno zdravstvo Federacije BiH obavlja nadzor nad radom i poslovanjem Zavoda. 
• Nadzorno vijeće ima 3 (tri) člana i to 2 (dva) ispred osnivača (Federacije Bosne i Hercegovine), a 1 (jednog) ispred uposlenika Zavoda, uz zastupljenost oba spola.
• Kandidati za članove u Nadzornom vijeću moraju ispunjavati kriterije utvrđene Odlukom o kriterijima za imenovanje u Nadzorna vijeća zdravstvenih zavoda i zdravstvenih ustanova čiji je osnivač jedan ili više kantona i Federacija Bosne i Hercegovine zajedno („Službene novine Federacije BiH“, broj 38/11).Predsjednika i članove Nadzornog vijeća imenuje i razrješava Vlada Federacije Bosne i Hercegovine, na prijedlog federalnog ministra zdravstva u proceduri suglasno propisima o ministarskim, vladinim i drugim imenovanjima u Federaciji BiH.
• Predsjednik i članovi Nadzornog vijeća imenuju se na period od 4 (četiri) godine, sa mogućnošću ponovnog izbora, a najviše za još jedan mandatni period.

Nadzorno vijeće:

• analizira izvješće o poslovanju Zavoda,
• obavlja nadzor nad upotrebom sredstava za rad pregleda godišnje izvješće o poslovanju i godišnji obračun,
• pregleda i provjerava urednost i zakonitost vođenja poslovnih knjiga,
• donosi Poslovnik o radu Nadzornog vijeća Zavoda,
• donosi godišnji plan rada Nadzornog vijeća Zavoda i godišnje izvješće o radu Nadzornog vijeća Zavoda,
• obavlja i druge poslove suglasno zakonu, kao i ovom Statutu.

Nadzorno vijeće Zavoda za svoj rad je odgovoran osnivaču, Vladi Federacije BiH i federalnom ministru zdravstva.